Epitranscriptomique & séquençage (EpiRNA-Seq)
Fiche plateforme
coordonnées
Email : virginie.marchand@univ-lorraine.fr
Télephone : 03 72 74 66 69
Adresse : UMS2008/US40 IBSLor Biopôle 9 avenue de la Foret de Haye 54505 VANDOEUVRE LES NANCY
Affiliation
Site Internet
https://umsibslor.univ-lorraine.fr/fr/plateforme/epitranscriptomique-sequencage-epirna-seq
Type d'activité
R&D
Domaine d'activité
- Génomique / transcriptomique
- Biologie moléculaire
- Bio-informatique
Description
La plateforme de épitranscriptomique et séquençage de l’UMS2008/US40 IBSLor est spécialisée et mondialement reconnue dans l'identification et la quantification des nucléotides modifiés au sein des ARN (Epitranscriptomique). Selon les projets de séquençage (de taille et d’importance différentes), la plateforme dispose d'un appareil de haut-débit Illumina Nextseq 2000, et d’un appareil de moyenne gamme MiSeq v3. L'ensemble de ces équipements permet d'optimiser au mieux le coût et la productivité. La plateforme dispose également d’appareils associés pour la fragmentation précise de l'ADN ou de l’ARN (Covaris M220) et pour la vérification de la qualité des échantillons et des bibliothèques de séquençage (électrophorèse capillaire Agilent BioAnalyzer 2100 et Tapestation 4150). La plateforme fonctionne par prestations de service pour les partenaires académiques (tarif préférentiel) ou industriels.
Mots clés
Next Generation Sequencing, Epitranscriptome, RNA-seq, small RNA-seq
Secteur
Public
Territoire
Lorraine